Die biochemische Evaluierung synthetisierter Verbindungen und neuer Naturstoffe ist ein essentieller Bestandteil der Wirkstoffentwicklung. Wir sind spezialisiert auf die Etablierung von Assays basierend auf Fluoreszenzintensität, Fluoreszenzpolarisation, HTRF®, Reportergen-Assays, und UPLC-MS. Dabei nutzen wir die gesamte Bandbreite der biochemischen und biophysikalischen Methoden. Wir stellen rekombinante Proteine in bakteriellen und eukaryotischen Systemen her und reinigen diese auf. Wir etablieren orthogonale zelluläre Testsysteme in Zelllinien oder primären Zellen. Einer unserer Schwerpunkte ist die Optimierung der Assaysysteme für den HTS-Einsatz am Fraunhofer IME - ScreeningPort. Für die Hit- und Leitstruktur-Validierung und –Charakterisierung nutzen wir modernste biophysikalische Methoden wie ITC, heteronukleare NMR-Methoden, Differential Scanning Fluorimetry und Röntgenkristallographie. Außerdem bestimmen wir routinemäßig die physikochemischen und in vitro pharmakokinetischen Parameter wie logS, logP, logD, pKa sowie die metabolische Stabilität in Lebermikrosomen unterschiedlicher Spezies.
Ausgewählte Projekte:
- HTRF basierter Assay für die Ligand-abhängige Rekrutierung von Co-Faktoren durch den nukleären Rezeptor PPAR
Ausgewählte Publikationen:
Achenbach, Janosch, Franca Maria Klingler, René Blöcher, Daniel Moser, Ann Kathrin Häfner, Carmen B. Rödl, Simon Kretschmer, et al. 2013. ‘Exploring the Chemical Space of Multitarget Ligands Using Aligned Self-Organizing Maps’. ACS Medicinal Chemistry Letters 4 (12): 1169–72. doi:10.1021/ml4002562.
Laufer, Stefan, Ulrike Holzgrabe, and Dieter Steinhilber. 2013. ‘Drug Discovery: A Modern Decathlon’. Angewandte Chemie - International Edition 52 (15): 4072–76. doi:10.1002/anie.201210006.
Meirer, Karin, Dieter Steinhilber, and Ewgenij Proschak. 2014. ‘Inhibitors of the Arachidonic Acid Cascade: Interfering with Multiple Pathways’. Basic and Clinical Pharmacology and Toxicology 114 (1): 83–91. doi:10.1111/bcpt.12134.
Moser, Daniel, Joanna M. Wisniewska, Steffen Hahn, Janosch Achenbach, Estella Buscató, Franca Maria Klingler, Bettina Hofmann, Dieter Steinhilber, and Ewgenij Proschak. 2012. ‘Dual-Target Virtual Screening by Pharmacophore Elucidation and Molecular Shape Filtering’. ACS Medicinal Chemistry Letters 3 (2): 155–58. doi:10.1021/ml200286e.
Roos, Jessica, Sabine Grösch, Oliver Werz, Peter Schröder, Slava Ziegler, Simone Fulda, Patrick Paulus, et al. 2016. ‘Regulation of Tumorigenic Wnt Signaling by Cyclooxygenase-2, 5-Lipoxygenase and Their Pharmacological Inhibitors: A Basis for Novel Drugs Targeting Cancer Cells?’ Pharmacology and Therapeutics 157. Elsevier Inc.: 43–64. doi:10.1016/j.pharmthera.2015.11.001.
Weber, Julia, Janosch Achenbach, Daniel Moser, and Ewgenij Proschak. 2015. ‘VAMMPIRE-LORD: A Web Server for Straightforward Lead Optimization Using Matched Molecular Pairs’. Journal of Chemical Information and Modeling 55 (2): 207–13. doi:10.1021/ci5005256.
Weber, Julia, Janosch Achenbach, Daniel Moser, Ewgenij Proschak, Julia Weber, Janosch Achenbach, Daniel Moser, and Ewgenij Proschak. 2013. ‘VAMMPIRE : A Matched Molecular Pairs Database for Structure-Based Drug Design and Optimization VAMMPIRE : A Matched Molecular Pairs Database for Structure Based Drug Design and Optimization’. doi:10.1021/jm400223y.
